Семинар 15 ноября 2012

Основная страница семинара: http://www.biophys.msu.ru/rus/science/complex_systems/seminar/
На этом форуме Вы можете задать вопрос о работе семинара или оставить заявку на участие.
Связаться с секретарём семинара Вы можете также по электронной почте mathbio@biophys.msu.ru.

Семинар 15 ноября 2012

Сообщение styx » 13 ноя 2012 19:16

Дорогие коллеги!

Наш семинар продолжает работу.

15 ноября в 11.00 состоится доклад Алексея Маслакова
(МГУ им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет, кафедра биофизики)

"Реконструкция электрон-транспортных процессов в реакционном центре фотосистемы II и построение кривой индукции флуоресценции с использованием GPU"

Аннотация:
Представлена математическая модель димерного суперкомплекса фотосистем II для описания начального участка кривой индукции флуоресценции хлорофилла а. Модель основана на симуляции электронтранспортных процессов в реакционном центре ФСII. В отличие от кинетических моделей, основанных на решении систем дифференциальных уравнений, этот метод позволяет изучать особенности гетерогенных систем, напрямую задавая параметры компонентов с отличными друг от друга свойствами.
При моделировании рассматривали поведение ансамбля, состоящего из статистически значимого числа фотосистем. Для каждого реакционного центра ФСII в ансамбле на каждом шаге симуляции (с временным интервалом 5 пс) рассчитывали вероятность изменения его состояния и далее случайным образом (с учетом вероятности того или иного изменения состояния) определяли, останется ли его состояние прежним или изменится, и каким образом. Также на каждом шаге симуляции для каждой фотосистемы рассчитывали вероятность высвечивания квантов флуоресценции и случайным образом определяли, произойдет ли это высвечивание на данном временном интервале, собирали данные о высвечивании квантов флуоресценции по всему ансамблю и строили кривую индукции флуоресценции. Как показывают экспериментальные данные, в случае отсутствия взаимодействия между отдельными реакционными центрами начальный участок кривой индукции флуоресценции имеет экспоненциальную форму, в случае их объединения в энергетически взаимосвязанный комплекс из двух ФС – сигмоидную. Это было учтено в модели введением вероятности энергетического обмена между объединенными в пару реакционными центрами.

Семинары проходят на каф. биофизики по четвергам в 11:00, ауд. 123
(компьютерный класс).

Ждем всех!

С наилучшими пожеланиями,
Александра Дьяконова,
Галина Юрьевна Ризниченко
styx
Site Admin
 
Сообщений: 115
Зарегистрирован: 06 фев 2007 15:36
Полное имя: Сергей Хрущёв

Вернуться в Семинар сектора информатики и биофизики сложных систем

cron